Сюжет повествует об бойце спец.подразделения, Патрике Грине, которого отправляют на разведку в исследовательский комплекс Пандорум. С комплекса был послан сигнал "SOS", после чего контакт был потерян. Патрик не подозревает, с чем именно ему предстоит столкнуться в тёмных коридорах Пандорума.